したっぱ昆虫細胞研究者のメモ

insectcell.exblog.jp
ブログトップ
2011年 05月 09日

SRAにハエセルライン45lineのmRNA-seqデータ上がってる!

NCBIが打ち切り表明をしているSRAに、D. melanogaster由来のセルラインのRNA Seqデータが45line分も上がってました!
したっぱ歓喜!!w
NCBI->SRA->"cell line"で検索で出てきます。
もしくは"SRX047232"などのアクセッション番号で検索すれば出てくるかと思われます。

公開したのは米エネルギー省のBerkeley Lab。
エネルギー省関係なくね?と思ったら、伝統のテーマみたい。Fluit Fly Sequencing As Genetic Research Milestone
今せっせとDLしてるけど、これはかなり楽しみ!

公開されているのは以下の45のセルラインのRNA Seqデータ。

2: SRX047232S2R+ cell line
3: SRX045359ML-DmD4-c1 cell line
4: SRX045358ML-DmD32 cell line
5: SRX045357ML-BG2-c2 cell line
6: SRX045356ML-DmD11 cell line
7: SRX045355CME W2 cell
8: SRX045354mbn2 cell line
9: SRX045353ML-DMD20-c5 cell line
10: SRX045352S1 cell line
11: SRX045351S3 cell line
12: SRX029219Sg4 cell line
13: SRX029218S3 cell line
14: SRX029217S2R+ cell line
15: SRX029216S2R cell line
16: SRX029215S2R+ cell line
17: SRX029214S1 cell line
18: SRX029213S1 cell line
19: SRX029212ML-DmD9 cell line
20: SRX029211ML-DmD8 cell line
21: SRX029210ML-DmD4-c1 cell line
22: SRX029209ML-DmD32 cell line
23: SRX029208ML-DmD32 cell line
24: SRX029207ML-DmD21 cell line
25: SRX029206ML-DMD20-c5 cell line
26: SRX029205ML-DmD17-c3 cell line
27: SRX029204ML-DmD17-c3 cell line
28: SRX029203ML-DmD16-c3 cell line
29: SRX029202ML-DmD16-c3 cell line
30: SRX029201ML-DmD11 cell line
31: SRX029200ML-DmD11 cell line
32: SRX029199ML-DmBG1-c1 cell line
33: SRX029198ML-BG2-c2 cell line
34: SRX029197ML-BG2-c2 cell line
35: SRX029196mbn2 cell line
36: SRX029195Kc167 cell line
37: SRX029194Kc167 cell line
38: SRX029193Kc167 cell line
39: SRX029192GM2 cell line
40: SRX029191GM2 cell line
41: SRX029190GM2 cell line
42: SRX029189CME W2 cell
43: SRX029188CME W2 cell
44: SRX029187CME L1 cell
45: SRX029186CME L1 cell
46: SRX0291851182-4H cell line


人気ブログランキングに参加しています。
応援よろしくお願いします。
FC2 Blog Ranking

[PR]

by koretoki | 2011-05-09 20:07


<< 次世代解析の特に比較に便利なR...      ヒト組織をNGSで解析して、そ... >>